Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cysrt1Q9D1E4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms