Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd3Q9D176 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms