Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm12Q9D0R8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms