Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E1

Hnrnpm, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpmQ9D0E1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpmQ9D0E1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HnrnpmQ9D0E1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HnrnpmQ9D0E1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HnrnpmQ9D0E1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HnrnpmQ9D0E1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms