Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms