Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms