Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elp3Q9CZX0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Elp3Q9CZX0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms