Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmss1Q9CZT6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmss1Q9CZT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms