Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms