Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl35Q9CZ49 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl35Q9CZ49 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms