Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snf8Q9CZ28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms