Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms