Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrs1Q9CYH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrs1Q9CYH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms