Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssu72Q9CY97 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssu72Q9CY97 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms