Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms