Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms