Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nip7Q9CXK8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nip7Q9CXK8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms