Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms