Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms