Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Malsu1Q9CWV0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Malsu1Q9CWV0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms