Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms