Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx10Q9CWT3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx10Q9CWT3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms