Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver1Q9CW46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms