Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sycp2Q9CUU3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sycp2Q9CUU3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sycp2Q9CUU3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sycp2Q9CUU3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms