Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Six6os1Q9CTN5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6os1Q9CTN5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms