Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc5Q9CRA8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms