Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rwdd1Q9CQK7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rwdd1Q9CQK7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms