Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd2aQ9CQJ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms