Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms