Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc5Q9CQA1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc5Q9CQA1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc5Q9CQA1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms