Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CQ90 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CQ90 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQ90 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms