Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms