Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med21Q9CQ39 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med21Q9CQ39 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms