Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dph6Q9CQ28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dph6Q9CQ28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms