Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms