Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms