Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg3Q9CPX6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms