Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms