Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2a1Q99PM3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2a1Q99PM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151 ms