Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rrbp1Q99PL5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrbp1Q99PL5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms