Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup155Q99P88 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup155Q99P88 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup155Q99P88 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms