Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rassf3Q99P51 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms