Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NsmfQ99NF2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NsmfQ99NF2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms