Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bco2Q99NF1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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