Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms