Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl3Q99N95 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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