Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl43Q99N89 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Mrpl43Q99N89 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Mrpl43Q99N89 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl43Q99N89 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl43Q99N89 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl43Q99N89 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Mrpl43Q99N89 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Mrpl43Q99N89 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Mrpl43Q99N89 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl43Q99N89 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms