Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac9Q99N13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms