Protein–RNA interactions for Protein: Q99N11

Dusp22, Dual specificity protein phosphatase 22, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp22Q99N11 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp22Q99N11 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dusp22Q99N11 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms