Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf17Q99MV7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms